ศูนย์บริหารสถานการณ์โควิด-19 หรือ ศบค. แถลงสถานการณ์โควิด-19 ประจำวันที่ 13 กัยยายน 2564 ว่า ล่าสุดมีผู้ติดเชื้อรายใหม่ 13,256 ราย แบ่งเป็นติดเชื้อในประเทศ 12,763 ราย ติดเชื้อจากเรือนจำ 478 ราย ติดเชื้อจากต่างประเทศ 15 ราย มีผู้เสียชีวิต 131 คน หายป่วยเพิ่มขึ้นอีก 13,829 ราย ยังรักษาอยู่ 128,367 ราย อาการหนัก 3,422 ราย ใส่เครี่องช่วยหายใจ 747 ราย
สำหรับรายละเอียดผู้เสียชีวิต อยู่ในกรุงเทพมหานคร 21 ราย จังหวัดปริมณฑลรวม 39 ราย ที่เหลือเป็นจังหวัดอื่นๆ ทั้งนี้มีเด็กวัยเพียง 2 เดือน เสียชีวิตด้วย 1 ราย ที่จังหวัดนนทบุรี โดยพบว่าเป็นโรคหัวใจตั้งแต่กำเนิด
ส่วนตัวเลขการฉีดวัคซีน เพิ่มขึ้น 64,6519 โดส สะสม 46,669,535 โดส แบ่งเป็น เข็มที่ 1 จำนวน 29,741,899 ราย คิดเป็น 41.3% ของประชากร เข็มที่ 2 จำนวน 16,303,999 ราย คิดเป็น 22.6% ของประชากร และเข็มที่ 3 จำนวน 623,637 ราย