นายศุภชัย ใจสมุทร ที่ปรึกษารองนายกรัฐมนตรี ได้รับการประสานงานจาก นางสาวศุภมาส อิศรภักดี รัฐมนตรีว่าการกระทรวงการอุดมศึกษา วิทยาศาสตร์ วิจัยและนวัตกรรม (อว.)ให้ เข้ามาประสานงาน ภารกิจ ติดตามนโยบายและตรวจสอบการดำเนินงานของกระทรวง อว. โดยเฉพาะกรณีการแก้ไขปัญหาการเสนอโปรดเกล้าฯแต่งตั้งอธิการบดี มสธ.ที่ยืดเยื้อยาวนานกว่า 7 ปี
โดย รัฐมนตรีว่าการกระทรวง อว.(นางสาวศุภมาศ อิศรภักดี)ได้พยายามอย่างยิ่งเพื่อหาทางออก จัดการเรื่องดังกล่าวนี้ให้ยุติโดยเร็ว จึงได้สั่งการให้มีการประชุมผู้ที่เกี่ยวข้องร่วมกันไปแล้ว เมื่อวันที่ 22 พฤศจิกายน 2566
“โดยที่ประชุมมีมติที่ประชุมร่วมกันอย่างชัดเจนว่า ขอให้ทางสภามหาวิทยาลัย มสธ.เร่งดำเนินการเสนอโปรดเกล้าฯแต่งตั้งอธิการบดี ให้เรียบร้อย โดยเร็ว ไม่จำเป็นต้องรอคำพิพากษาศาลปกครองสูงสุด ในกรณีคดีความการถอดถอนของอธิการบดีรายเดิม”
จนกระทั่งล่าสุดเมื่อวันที่ 8 ธันวาคม 2566 รัฐมนตรีว่าการกระทรวง อว. ได้มีหนังสือบัญชาสั่งการไปยัง สภามสธ. สั่งการเสนอแนะว่า ให้สภา มสธ.เร่งดำเนินการเสนอโปรดเกล้าฯแต่งตั้งอธิการบดี รายรศ.ดร.วรรณธรรม กาญจนสุวรรณ มายังสำนักงานปลัดกระทรวง อว.เพื่อให้มหาวิทยาลัยสามารถบริหารจัดการในเรื่องต่างๆได้อย่างมีธรรมาภิบาล
นายศุภชัย กล่าวว่า “จะเห็นได้ว่า รัฐมนตรีกระทรวง อว.ใช้อำนาจสั่งการตามพระราชบัญญัติระเบียบบริหารราชการ กระทรวง อว. พ.ศ. 2562 มาตรา 17 (10) ซึ่งหนังสือสั่งการฉบับนี้ ทางมสธ.ควรต้องเร่งรีบดำเนินการ และหนังสั่งการฉบับนี้ยังมีศักดิ์ทางกฎหมายที่สูงกว่าหนังสือความเห็นของอนุกรรมการด้านกฎหมายของกระทรวง อว.ที่ทางสภา มสธ.นำมาใช้อ้างว่า ต้องรอศาลพิพากษาก่อน ดังนั้น เรื่องนี้ต้องจบได้แล้ว ที่ผ่านมาไม่เกิดประโยชน์ใดๆกับมหาวิทยาลัยเลย ที่มีการประวิงเวลาไปเรื่อย ๆ เพราะการที่ไม่อธิการบดีตัวจริง จะทำงานเชิงบริหารที่มีประสิทธิภาพได้อย่างไร มีผลประโยชน์อะไรที่ปกปิดอยู่หรือไม่ และส่งผลกระทบต่อภาพลักษณ์ของมสธ.อย่างยิ่ง”